研究队伍
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姓  名:
李幸
学  科:
化学生物学与诊断治疗
联系电话:
010-84504251
电子邮件:
lix@biols.ac.cn
通讯地址:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号 100101
更多信息:
  
简历:

博士,研究员,博士生导师。吉林大学博士,哈佛大学与麻省理工学院博德研究所(Broad Institute of Harvard and MIT)化学生物学和治疗科学系、康奈尔大学药学院博士后。近年来,围绕“RNA成像、传感和化学调控”研究领域,开发小分子降解剂、调节剂和示踪剂,并结合RNACRISPR基因编辑等生物技术和工具,开展生命活动调控和追踪等研究,并应用于神经退行性疾病、遗传病、传染病等疾病的诊断与治疗。主持国家自然科学基金2项,包括面上基金、中国瑞典国际合作与交流项目;担任Frontiers in Chemistry期刊Guest Associate EditorJournal of the American Chemical SocietyAngewandte Chemie International EditionNature Chemical BiologyNature Communications等国际期刊发表论文20余篇,被引用1000余次

研究领域:

  1.RNA成像、传感与调控技术

   近年来,RNA领域不断涌现出重大科学突破,推动了生命科学变革式发展。RNA序列改变会造成RNA空间三维结构或者细胞中位置的改变,从而引发功能失调,并导致一系列疾病,如肌强直性营养不良、亨廷顿病、脊髓小脑性共济失调、脆性X相关的震颤/共济失调综合征、癌症肿瘤等。

   我们开展“RNA功能表征与化学干预”研究,研发高性能的荧光RNA适配体及其靶向小分子探针,实现原位、实时、单分子水平地追踪RNA,解析体内RNA的时空信息和功能。此外,我们重点关注神经退行性疾病与异常RNA的关系,致力于研发疾病RNA靶向小分子药物,干预疾病RNA活性与功能,为RNA药物研究奠定基础。

   我们研发基于荧光RNA的生物传感器来检测高等动物体内的小分子代谢物、蛋白质和离子,追踪其生物合成动力学,解析其代谢调控机制和关键酶活性,为癌症等疾病诊断提供理论依据。此外,基于荧光RNA生物传感器,构筑高通量药物筛选平台,鉴定并筛选代谢物酶靶标的小分子药物。

  2.CRISPR合成生物学

   基于CRISPR诊断技术被《Nature》评为2022年七大“颠覆性”技术之一,已应用于新冠病毒等各种病毒的分子诊断和染色体的时空追踪。我们开发基于CRISPR的染色体高分辨追踪技术,研究染色体有丝分裂、转录、断裂自修复等功能。此外,针对基因编辑CRISPR的生物安全问题开展研究,通过合成生物学手段引入光、小分子调控剂、RNA调控因子等开发各类CRISPR时空调控技术,为有效防范基因编辑引发的生物安全风险和精准调控基因编辑技术提供理论基础和工具方法。

  3.小分子药物与探针

   小分子探针和药物一直是创新药领域的主要驱动力。基于靶标RNA和疾病的密切关联我们致力于研发RNA靶向的小分子探针、靶向降解剂(RIBOTACs)、调控剂等,描述小分子追踪和干预靶标RNA功能的表型和作用模式,促进RNA成药性确证研究。此外,以昆虫体内嗅觉受体蛋白作为靶标,研发靶向小分子信息素和调节剂,从而化学干预嗅觉受体的功能,调控昆虫聚/散行为,实现昆虫灾害的绿色预防和精准控制。

代表论著:
近五年代表论著如下
  1. Chen, Z#;Duan, H#; Li, X.*,In vivo single-molecule RNA structural profiling. Trends in Biochemical Sciences (IF=14.264), 2023,48 (3), 211-212.
  2. Chen, W.#, Zhao, X.#, Yang, N*. Li, X.*, Single mRNA Imaging with Fluorogenic RNA Aptamers and Small-molecule Fluorophores. Angewandte Chemie International Edition  (IF=16.823)2023,e202209813.
  3. Li, X.*; Wu, J.; Jaffrey, S. R.*, Engineering Fluorophore Recycling in a Fluorogenic RNA Aptamer. Angewandte Chemie International Edition  (IF=16.823)2021, 60 (45), 24153-24161.
  4. Li, X.; Mo, L.; Litke, J. L.; Dey, S. K.; Suter, S. R.; Jaffrey, S. R.*, Imaging Intracellular S-Adenosyl Methionine Dynamics in Live Mammalian Cells with a Genetically Encoded Red Fluorescent RNA-Based Sensor. Journal of the American Chemical Society (IF=16.383) 2020, 142(33), 14117-14124.
  5. Li, X.; Kim, H.; Litke, J. L.; Wu, J.; Jaffrey, S. R.*, Fluorophore-Promoted RNA Folding and Photostability Enables Imaging of Single Broccoli-Tagged mRNAs in Live Mammalian Cells. Angewandte Chemie International Edition  (IF=16.823)2020, 59 (11), 4511-4518.
  6. Ma, K.; Li, X.*; Xu, B.; Tian, W., Label-free bioassay with graphene oxide-based fluorescent aptasensors: A review. Analytica Chimica Acta  (IF=6.911)2021, 1188, 338859.
  7. Modell, A. E.#; Siriwardena, S. U.#; Shoba, V. M.#; Li, X.#; Choudhary, A.*, Chemical and optical control of CRISPR-associated nucleases. Current Opinion in Chemical Biology (IF=8.822) 2021, 60, 113-121.
  8. Truong, L.; Kooshapur, H.; Dey, S. K.; Li, X.; Tjandra, N.; Jaffrey, S. R.; Ferré-D'Amaré, A. R.*, The fluorescent aptamer Squash extensively repurposes the adenine riboswitch fold. Nature Chemical Biology(IF=16.174) 2022, 18 (2), 191-198.
  9. Wu, J.; Svensen, N.; Song, W.; Kim, H.; Zhang, S.; Li, X.; Jaffrey, S. R.*, Self-Assembly of Intracellular Multivalent RNA Complexes Using Dimeric Corn and Beetroot Aptamers. Journal of the American Chemical Society (IF=16.383)2022, 144 (12), 5471-5477.
  10. Grozhik, A. V.; Olarerin-George, A. O.; Sindelar, M.; Li, X.; Gross, S. S.; Jaffrey, S. R.*, Antibody cross-reactivity accounts for widespread appearance of m1A in 5'UTRs. Nature Communications (IF=14.919)2019, 10 (1), 5126.
 
研究组成员:

博士后
纪鑫,宋浩志

研究生
陈振寅 博士生 2021年
蒋浩东 博士生 2022年
高万锴 硕士生 2022年

客座学者
张钟轩,李逸,徐存