研究队伍
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姓  名:
李幸
学  科:
化学生物学与诊断治疗
联系电话:
010-84504251
电子邮件:
lix@biols.ac.cn
通讯地址:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号 100101
更多信息:
  
简历:

  研究员、博士生导师、PI课题组长。哈佛大学与麻省理工学院博德研究所(Broad Institute of Harvard and MIT)化学生物学和治疗科学系、康奈尔大学药学院博士后。近年来,围绕“RNA化学生物学”研究方向,开发小分子降解剂、调节剂和示踪剂,并结合RNACRISPR基因编辑等生物技术和工具,开展生命活动调控和追踪等研究,并应用于神经退行性疾病、遗传病等疾病的诊断与治疗。在Journal of the American Chemical SocietyAngewandte Chemie International EditionNature Chemical BiologyNature Communications等国际期刊发表论文20余篇,被Nature等国际前沿期刊广泛引用和图文介绍。受邀在北京大学、北京协和医学院等单位开展学术讲座;担任《中国生物化学与分子生物学协会》、《中国化学协会》会员;担任Coordination Chemistry Reviews (IF>20) 等多类期刊审稿人。

研究领域:

  1.RNA化学生物学

   近年来,RNA领域不断涌现出重大科学突破,推动了生命科学变革式发展。RNA序列改变会造成RNA空间三维结构或者细胞中位置的改变,从而引发功能失调,并导致一系列疾病,如肌强直性营养不良、亨廷顿病、脊髓小脑性共济失调、脆性X相关的震颤/共济失调综合征、癌症肿瘤等。

   我们开展“RNA功能表征与化学干预”的化学生物学基础研究,研发荧光RNA适配体及其靶向小分子探针,实现原位、实时、动态地追踪RNA,解析体内RNA的时空信息和功能。进一步,追踪肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)/额颞叶痴呆(FTD)等神经退行性疾病中的异常mRNA,时空上理解ALS/FTD疾病的致病机理。另一方面,我们重点关注ALS/FTD等疾病与异常RNA的关系,致力于研发疾病RNA靶向小分子药物,干预疾病RNA活性与功能,为RNA药物研究奠定基础。

   此外,我们开发高效RNA生物传感器来检测高等动物体内的小分子代谢物及其生物合成动力学,解析其代谢调控机制,为癌症等相关疾病诊断提供理论依据。

  2.CRISPR合成生物学

   基于CRISPR诊断技术被《Nature》评为2022年七大“颠覆性”技术之一,已应用于新冠病毒的分子诊断和染色体的时空追踪。我们开发基于CRISPR的染色体高分辨追踪技术,研究染色体有丝分裂、转录、自修复、易位、基因编辑等功能。并且,结合精原干细胞体外减数分裂模型,来研究减数分裂过程中染色体行为,揭示唐氏综合征、巴陶氏综合症等染色体遗传病分子机制。此外,针对基因编辑CRISPR的生物安全问题开展研究,通过合成生物学手段引入光、小分子调控剂、RNA调控因子等开发各类CRISPR时空调控技术,为有效防范基因编辑引发的生物安全风险和精准调控基因编辑技术提供理论基础和工具方法。

  3.小分子药物与探针

   小分子探针和药物一直是创新药领域的主要驱动力。我们针对具备重要科学意义的RNA,致力于研发小分子探针、靶向降解剂(RIBOTACs)、调控剂等,描述小分子追踪和干预目标RNA功能的表型和作用模式,促进RNA成药性确证研究。此外,针对昆虫体内嗅觉受体蛋白,研发靶向小分子信息素和调节剂,从而化学干预嗅觉受体的功能,调控昆虫聚散行为,实现昆虫灾害的预防和控制。

代表论著:
近五年发表论著如下
  1. Truong, L.; Kooshapur, H.; Dey, S. K.; Li, X.; Tjandra, N.; Jaffrey, S. R.; Ferré-D'Amaré, A. R.*, The fluorescent aptamer Squash extensively repurposes the adenine riboswitch fold. Nature Chemical Biology 2022, 18 (2), 191-198.
  2. Wu, J.; Svensen, N.; Song, W.; Kim, H.; Zhang, S.; Li, X.; Jaffrey, S. R.*, Self-Assembly of Intracellular Multivalent RNA Complexes Using Dimeric Corn and Beetroot Aptamers. Journal of the American Chemical Society 2022, 144 (12), 5471-5477.
  3. Li, X.*; Wu, J.; Jaffrey, S. R.*, Engineering Fluorophore Recycling in a Fluorogenic RNA Aptamer. Angewandte Chemie International Edition 2021, 60 (45), 24153-24161.
  4. Ma, K.; Li, X.*; Xu, B.; Tian, W., Label-free bioassay with graphene oxide-based fluorescent aptasensors: A review. Analytica Chimica Acta 2021, 1188, 338859.
  5. Modell, A. E.#; Siriwardena, S. U.#; Shoba, V. M.#; Li, X.#; Choudhary, A.*, Chemical and optical control of CRISPR-associated nucleases. Current Opinion in Chemical Biology 2021, 60, 113-121.
  6. Moon, J. D.; Wu, J.; Dey, S. K.; Litke, J. L.; Li, X.; Kim, H.; Jaffrey, S. R.*, Naturally occurring three-way junctions can be repurposed as genetically encoded RNA-based sensors. Cell Chemical Biology 2021, 28 (11), 1569-1580.
  7. Li, X.; Mo, L.; Litke, J. L.; Dey, S. K.; Suter, S. R.; Jaffrey, S. R.*, Imaging Intracellular S-Adenosyl Methionine Dynamics in Live Mammalian Cells with a Genetically Encoded Red Fluorescent RNA-Based Sensor. Journal of the American Chemical Society 2020, 142 (33), 14117-14124.
  8. Li, X.; Kim, H.; Litke, J. L.; Wu, J.; Jaffrey, S. R.*, Fluorophore-Promoted RNA Folding and Photostability Enables Imaging of Single Broccoli-Tagged mRNAs in Live Mammalian Cells. Angewandte Chemie International Edition 2020, 59 (11), 4511-4518.
  9. Grozhik, A. V.; Olarerin-George, A. O.; Sindelar, M.; Li, X.; Gross, S. S.; Jaffrey, S. R.*, Antibody cross-reactivity accounts for widespread appearance of m1A in 5'UTRs. Nature Communications 2019, 10 (1), 5126.
  10. Song, W.; Filonov, G. S.; Kim, H.; Hirsch, M.; Li, X.; Moon, J. D.; Jaffrey, S. R.*, Imaging RNA polymerase III transcription using a photostable RNA-fluorophore complex. Nature Chemical Biology 2017.
研究组成员:

研究生
陈振寅 博士生 2021年

客座学者

张钟轩